تضم مكتبة الدير، الذي بُني بين 584 و565، ثاني أكبر مجموعة من المخطوطات في العالم. وفيها مخطوطات باللغات اليونانية، العربية، الآرامية، القبطية، العبرية، الجورجية، والارمينية. أما المخطوطات العربية فعددها 602، أقدمها يعود إلى القرن الثامن. ومعظم هذه المجموعة هي كتب دينية: كالكتاب المقدس بعهديه، وكتب ليتورجية، وسنكسارات القديسين، وعظاتهم، بالاضافة إلى بعض الكتب الليتورجية.
