كنيسة مار إليان - القدّيس إليان الذي عيده في 6 شباط - هي كنيسة أرثوذكسيّة أثرية قديمة تقع في مدينة حمص وسط سوريا.
المجموعة تتألف من 38 مخطوطا معظمها ذات طابع طقسي.
تحوي الكنيسة رفات القدّيس إليان الحمصي، القديس المسيحي الذي استشهد خلال الإضطهادات الرومانية للمسيحيين في القرن الثالث.
تقع الكنيسة في شارع طرفة بن العبد بالقرب من بوابة تدمر داخل حمص القديمة.
ي العام 432 صدر أمر ببناء كنيسة كبيرة في حمص وفي عام 451 قرر بولس أسقف المدينة نقل رفات القدّيس من المغارة إلى الكنيسة وتوسعتها على نفقته الخاصة.
وقد وضع بها ناووس كبير يحوي رفات القدّيس إذ بلغ طول الناووس 23،2م وعرضه 35،1م أما ارتفاعه 6,1م؛ وله غطاء هرمي الشكل، يزيّن جوانبه مع الغطاء 11 صليباً نافراً.